Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VdrP48281 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VdrP48281 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VdrP48281 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VdrP48281 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VdrP48281 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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VdrP48281 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VdrP48281 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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