Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms