Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sept1P42209 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms