Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LtbP41155 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LtbP41155 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LtbP41155 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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LtbP41155 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms