Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms