Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
VhlP40338 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms