Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tjp1P39447 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms