Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rom1P32958 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rom1P32958 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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