Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc11P31313 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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