Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa2P31245 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa2P31245 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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