Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vcam1P29533 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms