Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprmP28828 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
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PtprmP28828 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprmP28828 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprmP28828 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtprmP28828 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtprmP28828 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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PtprmP28828 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprmP28828 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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