Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col2a1P28481 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col2a1P28481 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col2a1P28481 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col2a1P28481 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col2a1P28481 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms