Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChgaP26339 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms