Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NdnP25233 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NdnP25233 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NdnP25233 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NdnP25233 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NdnP25233 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NdnP25233 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms