Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6bP23440 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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