Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TP20293 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TP20293 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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TP20293 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TP20293 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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TP20293 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TP20293 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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TP20293 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TP20293 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms