Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P20040 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P20040 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P20040 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P20040 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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P20040 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
P20040 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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P20040 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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P20040 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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P20040 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
P20040 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
P20040 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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