Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnnc1P19123 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms