Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Sdc1P18828 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sdc1P18828 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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