Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PtpraP18052 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PtpraP18052 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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