Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms