Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Vpreb1P13372 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Vpreb1P13372 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms