Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Calb1P12658 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms