Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
UbbP0CG49 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbbP0CG49 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms