Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxb3P09026 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxb3P09026 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms