Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TtrP07309 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
TtrP07309 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
TtrP07309 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms