Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01789 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P01789 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P01789 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01789 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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