Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ccl20O89093 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccl20O89093 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms