Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Stra6O70491 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms