Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Foxq1O70220 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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