Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ldb2O55203 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ldb2O55203 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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