Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SlkO54988 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SlkO54988 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SlkO54988 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SlkO54988 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms