Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn5O54942 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms