Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smarce1O54941 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smarce1O54941 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms