Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DffaO54786 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DffaO54786 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DffaO54786 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DffaO54786 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DffaO54786 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DffaO54786 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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DffaO54786 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DffaO54786 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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