Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
CrxO54751 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
CrxO54751 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CrxO54751 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms