Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sdc4O35988 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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