Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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