Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RaxO35602 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaxO35602 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RaxO35602 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms