Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pkd2O35245 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd2O35245 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms