Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Eftud2O08810 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Eftud2O08810 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms