Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PrkcshO08795 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcshO08795 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms