Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Barx2O08686 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Barx2O08686 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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