Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sema3aO08665 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms