Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sec22bO08547 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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