Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3278L7N2D2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3278L7N2D2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms