Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vwa3bJ9JI28 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms