Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm2056J3QQ02 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm2056J3QQ02 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms