Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm2035J3QP87 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm2035J3QP87 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms